珠江水资源保护科学研究所成立于1989年，是具有独立法人资格的二类事业单位，主要从事流域水资源节约与保护、水生态治理与修复、水资源监督与管理技术支撑，以及水利行业技术咨询、环境保护技术咨询服务工作。科研所下设两个职能部门和五个业务科室，出资开办广州珠江水资源保护科技发展有限公司，运行管理红水河珍稀鱼类保育中心。科研所于1989年获得全国第一批环境影响评价甲级资质证书，评价范围涉及水利水电、交通运输、社会区域，拥有注册环评工程师16人，具备编制流域综合规划环境影响报告书、大型水利水电工程环境报告书能力，为生态环境部建设项目环境影响评价信用平台备案单位。科研所现有各类专业技术人员86人，专业涉及水文水资源、水利工程、环境科学、环境工程、流体力学、生态学、给排水工程、渔业及水产养殖等领域。博士学历7人，硕士学历61人，取得环评工程师资格证书的有16人，环保工程师资格证书1人。拥有水资源论证单位水平评价证书（甲级）、水文、水资源调查评价单位水平评价证书（甲级）、广东省环境影响评价编制单位水平评价证书（5星）、工程咨询单位乙级资信证书、生产建设项目水土保持方案编制单位和水土保持监测单位水平评价证书（3星）等多项资质。
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